شورای عالی علوم، تحقيقات و فناوري، كه یکی از عمدهترین نهادهای فعال در عرصه سیاست گذاری علم و فناوري است ، در جهت ارتقای کیفیت سیاست گذاری در زمینه های مختلف علوم، تحقیقات و فناوری و راهبری توسعه فناوری های دارای اولویت ملی، اقدام به تشكيل كميسيون هاي تخصصي دوازده گانه بر اساس ماده 3 آییننامه داخلی شورای عالی علوم، تحقیقات و فناوری مصوب دومین جلسه شورا مورخ 3/2/1385 و همچنین بر اساس مصوبات 2 الی 4 سومین جلسه شورای عالی علوم، تحقیقات و فناوری مورخ 18/7/85نموده است. از مهمترين وظايف كميسيون هاي تخصصي مي توان به اولويت بندي و پیشنهاد اجرای طرح هاي اجرائي بلندمدت سرمايه گذاري كلان در بخش هاي آموزشي، پژوهشي و فناوري و همچنين بررسي و پيشنهاد منابع مالي مورد نياز در حوزه هاي علوم، تحقيقات و فناوري اشاره كرد.
لازم بذكر است این شورا از یک سو با بهره مندی از متخصصان حوزههای مختلف، فعالیت جدی و مؤثری را در توزین و توزیع کلان بودجههای تحقیقاتی انجام داده و از سوی دیگر با اتکاء به جایگاه قانونی خود، نقش مهمی را در بازبینی فرآیندها و ارزیابی بروندادهای پژوهشی دستگاه اجرایی ایفا کرده است. با توجّه به اهمیت نقش نهادینه شده این شورا و نیز لزوم تقویت جایگاه سازمانی آن، باید به صورت ادواری بازتاب مناسبی از عملكرد تخصصی شورا تهیه و ارائه شود. لذا شوراي عالي علوم، تحقيقات و فناوري در راستاي پيشبرد اهداف و با توجه به نقش مهم خود در تعيين سياستهاي كلان علم و فناوري، اقدام به تشكيل كميسيونهاي تخصصي در زمينههاي موضوعي مختلف نموده است كه هركدام بر اساس نياز جامعه در آن حوزه فعاليت ميكنند. ميتوان گفت اين كميسيونها كه از مجموعهاي افراد داراي صلاحيت علمي در زمينة موضوعي مرتبط تشكيل شدهاند، نقش مهمي را در تعيين اولويتهاي تحقيقاتي و پژوهشي كشور ايفا كرده و با تصميمگيري در اين زمينه نقش بسزايي در تخصيص بودجههاي پژوهشي در حوزههاي مختلف دارند.